A mostani bejegyzésünkben a Linux és Windows alatt futó programokat fogjuk tárgyalni. Amint már említettem a programok nagyon nagy részét Winowsra optimalizáják, készítik.Ezért van olyan, hogy egyes programok nem működnek linux alatt, de ugyanez igaz fordítva is. Az előző bejegyzésben tárgyal virtuális rendszerek még arra is jók, hogyha Windowssal rendelkezze, és szükéged lenne valamilyen linux alatt futó programra. Előveszed a sépci programodat, felrakod a gépre, egy linuxot hozol létre benne, és feltelepíted rá. Ez fordítva is igaz, hogy Linuxszal rendelkezel, és Windows alatti programra van szükséged, akkor szintén használhatsz virtuális géped, de vannak emuláláló programok, vagy mik ezek segítségével windowsos programjaid nagy részét futtathatod linuxos környezetben is. Ilyen program pl:: A Wine. A Legtöbb programnak van alternatívája. A Windows alatti prograok között sok a fizetős, a linux alatti programok 95%-a mind ingyenes. Ebbe a táblázatba néhány programot, és annak alternatíváját hasonlítjuk össze:
| Feladat | Windowsra való program | Linuxra való alternatívája |
| Operációs rendszer | Windows különböző verziói pl.:7, Vista, Xp, 2008 Server, 2003 Server stb. | Linux, és annak disztrójai pl.: Ubuntu, OpenSUSE, PClinuxOS, Mandriva, Debian stb.. |
| Ablakkezelő | Windows saját ablakkezelője | KDE, Gnome, Xfce, Elightment, ICEWM, stb.. |
| Irodai feladatok | Microsoft Office | KOffice, OpenOffice, Abiword és társai |
| Böngészés | MS Internet Explorer, Safari(leginkább Mac-re jellemző) | Mozilla Firefox(eredetileg linuxra tervezték), Google Chrome, Konqueror, Opera |
| Vezérlőközpontok | Vezérlőpult | YaST, YaST 2(OpenSUSE), saját vézérlőközpontok |
| Webszerkesztő | Microsoft Frontpage | NVU, Kompozer |
| Videólejátszó | Microsoft Media Player, PowerDVD | Mplayer, VLC player |
| Lemezíró programok | Nero, Clone CD, Clone DVD | K3b |
*A dőlt betűvel írt programok nevei Windows alatt is megtalálhatóak már, de eredetileg Linux alá tervezték, készítették őket
